A Lagoa Frouxeira se encuentra en la Red Natura 2000, una red ecológica de áreas de conservación de la Unión Europea. Está sujeta a medidas de protección destinadas a preservar su biodiversidad y hábitats naturales. Existen regulaciones locales y nacionales para salvaguardar este entorno natural tan maravilloso. En ella puedes encontrar diversas aves acuáticas, como patos, garzas, cormoranes y gaviotas. La variedad de especies puede variar según la temporada y las condiciones ambientales.
En primavera y verano, es común observar aves migratorias como fochas, cercetas, zarapitos y correlimos . En otoño, podrías ver la llegada de otras especies migratorias, mientras que en invierno algunas aves residentes y migratorias permanecen, como los ánades reales, las garzas, las espátulas, y las gaviotas. La diversidad de aves puede cambiar a lo largo del año, ofreciendo oportunidades únicas para la observación de aves en diferentes estaciones.